而加拿大苦于没有破冰船，只能提出口头抗议，称丹麦所为是对加拿大主权的侵犯。但加拿大由此认识到，为防备和应对类似丹麦的挑衅，仅仅发出维护领土主权的声音是不够的，还应切实采取行动保卫“领海岛屿主权”。于是加拿大开始努力强化本国在北极圈地区的军事存在。2004年8月，加拿大军队在北极圈内展开了一场声势浩大的代号为“独角鲸”的海、陆、空联合军事演习，以宣示其军事力量在北极存在的决心。2005年，加拿大士兵登上该岛，插了一面加拿大国旗，埋了一瓶加拿大威士忌，同年前加拿大国防部长格兰姆也踏上汉斯岛。为示抗议，丹麦传召加拿大大使，谴责加方踏足汉斯岛，并派出舰队在汉斯岛的周边来回巡逻。另外，两国还在Google上做广告，都宣称对汉斯岛拥有主权，甚至两国的网友都在网上互相指责。2006年7月，加拿大为进一步强化其主权宣誓效果，派出军队再次登上该岛。加拿大外交部长乘坐直升机前往视察，宣布汉斯岛“永远属于加拿大”。这一举动再次引起了丹麦政府的抗议。到目前为止，小岛的争夺仍看不到双边解决的希望。

加拿大的目光所向远不止大陆架延伸，“西北通道”是加拿大在北极地区的另一重要利益，这也是让加拿大与亲密盟国美国陷入争议的焦点。西北通道位于加拿大的北极群岛之间，从戴维斯海峡沿着加拿大北岸或横穿加拿大北极群岛到阿拉斯加，是连接大西洋和太平洋的一条重要极区航道，每年有一段时间可以通航，成为国际海运航线的一部分。现在这部分水域是作为加拿大内海而被加拿大政府控制的。加拿大政府宣称，它们相当于连接各个岛屿的桥梁，因而属于内水。

但是，随着全球气候变暖，冰层进一步融化将使“西北通道”通航潜力越来越大，一年中有好几个月的时间可以为大型远洋货轮开放，这将大大缩短欧洲通往美洲和亚洲的航线。例如，从英国伦敦通向日本东京的海运线目前需要绕道巴拿马运河，如能穿行加拿大北极群岛地带的话，那么整个航程将由现在的2.8万千米缩短为1.64万千米。有学者预言，如果西北通道有半年的开放时间，将大大改变全球的贸易结构，并对世界经济产生重要影响。如果该通道被判定为加拿大内水，单单靠收取过往船只的税金就能发一笔横财。

西北通道是美国将阿拉斯加的石油运至东部市场的捷径，也是美国核潜艇进出北冰洋的便捷通道。美加两国长期以来就西北通道的国际地位存在着分歧。美国认为，西北通道是一条国际海峡，各国均有权“过境通行”，加拿大的见解恰恰相反。早在1956年，当时的加拿大北方事务部长在众议院的听证会上说，加拿大的主权不仅及于陆地，而且也及于领水。1969年加拿大前总理特鲁多再次强调北极群岛的水域是加拿大水域。

1970年4月8日，加拿大针对美国“曼哈顿”号轮船穿越西北通道，通过了《北极水域污染防止法》。该法在北极水域设置了100海里的污染防止区，在该区域内加拿大可以控制航运，规定船舶的航行标准，并在必要时禁止航道的通行。对加拿大的行动，美国作出了强烈反应，欧盟和日本也表示质疑。美国声明：国际法并没为这些单方面将其管辖权扩展至公海的行为提供基础；美国既不接受也不默认这类管辖权的主张。美国认为加拿大的行为不正当地干扰了船旗国的管辖权。加拿大方面也不甘示弱，宣称由于国际海事组织多年来没有就污染控制达成国际社会可接受的标准，沿海国有权以自卫形式保护其海岸。另外，加方声称，此举旨在履行国际社会所赋予其在保护海洋环境的责任。在第三次联合国海洋法会议上，由于加拿大的不懈努力，《联合国海洋法公约》载入了关于“冰封区域”环境保护的条款，从而使加拿大的国内立法合法化。这对于加拿大将北方群岛水域内水化的倾向十分有利。

1985年美国的一艘破冰船通过了西北通道，拒绝知会加拿大，美加再起纠纷。当时的外交部长克拉克强硬声明：加拿大对北极的主权是不可分割的，它包括陆地、海洋和冰，扩及北极岛屿海岸相关海域。这些岛屿是互相连结的，不可分开的。加拿大政府的政策是维护加拿大北极群岛的自然统一，维护加拿大对陆地、海洋和冰的不可减损、不可分割的主权。为此，加拿大采取直线基线法划定其群岛水域，并视这类水域为加拿大的历史性内水。每年春季巡逻，夏季演习几乎成了加拿大海军不成文的规矩。2005年加拿大政府发射“雷达二号”人造卫星，对北极地区过往船只实施监控。2007年7月9日加拿大政府宣布，将在北极群岛地区修建一个深水港，作为加拿大海军基地和商运码头，以增强在北极地区的军事存在，维护对“西北通道”的主权。

另一方面，加拿大在拒绝接受美国观点的同时，也注意到了美国在该地区的利益。它保证西北通道为所有国家的船只开放，但需遵守加拿大政府所规定的要求，以保护加拿大北极地区的生态平衡。加拿大海军指挥官布拉克利准将调侃“这就像你家屋后的小路，没有人会在意邻居走这条道，但你不能拿走我家花园里的蔬菜。”