1469年，国王阿丰索五世责成里斯本的冒险家费尔南·戈姆斯以固定的价格销售从几内亚收集来的象牙，授予这个富商对今塞内加尔和冈比亚地区拥有五年时间的贸易垄断权，附加条件是每年得向前探察100里格（League 里格，一种长度名。它是陆地及海洋的古老的测量单位）约500多千米长的海岸线。戈姆斯基本上按期完成了任务。他派出船只对几内亚湾以北约2000多千米的海岸线进行了探索，结果发现了盛产大象的象牙海岸，产金较多的黄金海岸和人口稠密、可以大量掳掠奴隶的奴隶海岸。戈姆斯派出的最后一支探险队在西格拉的指挥下，发现了位于北纬4°的喀麦隆火山。而后他航进到南纬2°，成为了第一个越过赤道进入南半球的西欧航海家，从而否定了古代以来认为赤道地区热得无法忍受，无人居住的传统观点。他还发现了赤道附近的圣多美岛和普林西比岛。在此之前，一直向东延伸的几内亚海岸使葡萄牙人以为，沿非洲“南岸”向东航行就会驶入印度洋，但从喀麦隆火山起，西格拉发现海岸线直转向南，这至少表明，在赤道地区不可能航入印度洋。

1474年协议到期后，若奥二世又把贸易垄断权赋予戈姆斯的儿子约翰。

1482年6月，葡萄牙航海家第奥古·考奉命出航。他从米纳南下航行了约700千米，发现了黑非洲第一大河刚果河河口。他在河口北岸立起了他的第一根石柱，这也是探航西非海岸以来的第一根纪念石柱。

1479年，葡萄牙、西班牙在长期争吵后，经教皇调解，达成第—个划分海外势力范围的协议。加那利群岛归西班牙，因为在谁最先发现的问题上虽争论不清，但西班牙人早在1393年便从那里运回了奴隶，1402年便在那里修建了第一个欧洲人的永久居住点。同时将待发现的世界以穿过加那利群岛的纬线为界分成南北两个部分，北部由西班牙去发现，南部由葡萄牙去探索。由此可见，葡、西划分海外势力范围和扩张方向的第一个条约不是人们常以为的1494年的托尔德西亚斯条约，而是1479年在西班牙小镇阿尔卡索瓦斯签订的条约。划分海上霸权和势力范围的事情历史上也曾有过，但只限于局部地区。大航海导致了地理大发现，这才有了在全世界划分海上霸权和扩张方向的可能。不过由于当时的客观条件和具体情况，阿尔卡索瓦斯条约的约束范围实际上只限于大西洋地区，即“平”分了大西洋。1481年教皇西斯克斯四世发布教谕，肯定了葡、西对海上霸权和海外利益的划分。

从戈姆斯开始，葡萄牙还对在西非的发现实行严格保密的政策，以保持垄断。这在地理发现史上称“缄默的密谋”(conspiracy of silence)，以后它被长期执行并影响广泛。20世纪70年代强化实行的“发现承包租让责任制”、“缄默的密约”和阿尔卡索瓦斯条约表明，这时葡萄牙在西非探航的最终目的已更加明确，即避开穆斯林的势力，开辟去印度的新航路。

1481年若奥二世继位后，加大了探索西非的力度。他派遣以阿桑布雅为首的船队前往黄金海岸，在今加纳海岸修建了圣乔治·达·米纳城堡，意为在金矿上的圣乔治（后简称为埃尔米纳，“米纳”意为矿藏）。它是葡萄牙人在西非沿岸继阿尔金后的第二个殖民据点，并成为在几内亚湾和西非中部进行探险和殖民活动的中心和基地。若奥二世还向西非各处内陆续派出传教士、使节、探险者、商人，进行渗透。若奥二世还特别组建了学术委员会荣塔(Junta)，由杰出的犹太学者维任霍和札苦托主持。札苦托用希伯来文编纂制订了《万年历》，书中包括太阳的赤纬全表，维任霍还把它译成了拉丁文。维任霍还航行至几内亚湾的费尔南多·波，测定了太阳的赤纬，维任霍的同行者中还有纽伦堡的著名地理学家马丁·倍海姆。维任霍的观测导致采用有分度的航海图。维任霍后来又搞出了《万年历》的缩写本，该本还收有萨克罗波斯科的《星盘和四分仪指南》的修订本。所以，在航海、探险、发现的学术研究上，若奥二世继承和发展了他的叔祖父航海家恩里克开创的事业。