《沉默的世界》使库斯托声名鹊起，而《没有阳光的世界》令库斯托家喻户晓。20世纪60、70年代，正值旺年的库斯托先后拍摄了60多部影片，美国各大广播影视公司纷纷买下播映权。千千万万第一次看见美丽奇异的深海世界的人们也喜爱上了这个眷恋在蓝色广袤“农田”中耕耘的老顽童。人们并不用他所拥有的许多正式头衔称呼他，而是亲切地称他为“库斯托船长”。1985年，库斯托进行了一次“重新发现世界”的远航。在这次航行中，库斯托发现，海洋污染严重，20世纪50年代的好风光一去不复返，而破坏海洋环境的就是人类本身。75岁的库斯托开始投入到另一场征战当中，库斯托利用他所享有的声誉以及他同许多国家领导人的良好关系，在世界各地奔波。他同几位科学家联合起草了“为了后代人的宣言”，并征集到500万人的签名，送到联合国总部，要求将宣言的主要内容写进联合国宪章。他向联合国教科文组织建议，成立一支保卫环境的“绿盔部队”。这些建议和设想虽然还未能付诸实现，但库斯托让全世界听到了他充满忧患的呼吁，让世人感到了保护环境的紧迫性。库斯托说：“我坚信，未来我们在深海探险的主要目的将不仅仅是开发新的资源。但是，这也并不影响我们发明更好的潜水艇、呼吸器以及填充混合物。而大众观念的改变，有赖于科学家、诗人、画家、作家以及哲学家们找到合适的语词向大众诠释海底未知而玄妙的世界。”

1997年6月15日，库斯托因呼吸疾病去世，享年87岁。