但在天启五年（1625），发生了一件令许心素伤心的事，他的把兄弟及盟友李旦去世了。由于当时海盗数量颇多，少了李旦的支持，海上航行的安全问题将非常严峻。虽然许心素要求荷兰人帮他肃清漳州至大员航线的海盗，同时给予他一定的武器人员以自卫。但效果并不是很好，天启六年（1626）他还是被迫交了2000 两买渡费给海盗以保证航行的安全。此外，许心素还因“勾引”荷兰人进行贸易而受到来自官府的压力，并因在天启五年（1625）时荷兰人再次前往漳州海域，被勒令罚交“脏银”五千两。

面临这种状况，许心素决定投身官府，以官府的力量保护自己。他先以二万金买通了当时海防的关键人物——总兵俞咨皋，成为俞的心腹，而后积极促使俞总兵同意招抚海盗。天启六年（1626）许心素终于劝服俞咨皋招抚杨禄等海盗，随后当上了水师把总，统领刚招抚的杨禄及其手下。

在成为官商后，许心素作为地方官府与荷兰人的中间者，成为唯一一个获得与荷兰人贸易许可的商人。利用这么大的一个优势，许心素几乎以承包形式包揽了荷兰东印度公司与中国的全部生意，垄断了中国与荷兰人的贸易。尽管荷兰人为降低生丝价格，采取了各种办法，如不惜调高在大员的生丝价格（将原来的每担140两提高到150两）以吸引其他走私商人、暗地里到漳州海域以125两一担甚至115两一担的低价收购其他走私商人的生丝等等，但没有成功，许心素于1627年1月7日用5条帆船从漳州给荷兰人运去的200担生丝和后来得到荷兰东印度公司给予的用于购买200至300担生丝的定金，均拿到了每担142两的高价。许心素不但与海外巨商李旦关系密切，而且于本土精心经营，有开拓台海贸易之功，称得上明末本土海商的一号人物。

东西扬名的郑芝龙

郑芝龙，号飞黄，福建南安人，以中国南部及日本等地为活跃舞台的商人，在西方文献中，以一官闻名于世。

郑芝龙年18岁时，至澳门的舅舅黄程处学习经商，当时澳门已经为葡萄牙占领，有不少福建人在那边跟葡萄牙人做买卖。郑芝龙很快就学会了同葡萄牙人打交道，也学了一点葡萄牙语。他甚至信奉了天主教，接受洗礼，取教名尼古拉斯。

郑芝龙到了澳门之后，跟许多闽南人一样，想往海外发展。他选择了日本，到了日本平户定居。郑芝龙初到平户，主要依靠当地的闽南乡亲，当过裁缝，也卖过鞋子，生活困顿得很。但是，他在一次走海押货时遇到了中日通商贸易史上的传奇人物——李旦，并成了李旦的义子，为他后来整合中国海商力量、叫板荷兰等西方殖民者打下坚实的基础。

天启五年（1625），郑芝龙继承了李旦的事业船队，同时又接手颜思齐的武装船队，并从福建招来了郑兴、郑明、杨耿、陈晖、郑彩等部将，并将部下分为十八先锋，结为“十八芝”，初步形成自己的海上武装力量。

天启六年（1626）春，他乘福建天旱饥荒之机，自率船队袭击闽粤，朝廷起用曾任泉州知府的蔡善继出任泉州巡海道，对他进行招抚，但没有成功。崇祯元年（1628），羽翼已丰的郑芝龙攻入中左所（厦门），随后取代许心素在台海贸易中的地位，并以“海防游击”身份接受福建巡抚熊文灿的招安。

郑芝龙受抚后，原先和他一起出生入死的刘香一伙心有不甘，拉到了广东，继续其海上劫掠的营生。这股势力与荷兰人勾结，使台湾海峡又转趋不平静，对郑芝龙也造成了很大的威胁。郑芝龙誓欲扫除刘香。崇祯五年（1632）12月4日，郑芝龙与刘香的船队在福建附近遭遇，从早上血战到傍晚，双方死伤惨重，最后刘香败逃。崇祯六年（1633）7月，新任荷兰台湾长官普特曼斯为了迫使明朝开放贸易，准备攻打福建沿海，于是与刘香勾结，对驻守厦门的郑芝龙部将和朝廷官兵发动突袭，明军损失战船20多艘。崇祯六年（1633）9月，普特曼斯与刘香会于大员（今台南安平），准备再度进攻郑芝龙。郑芝龙誓师出发，在遭遇战中焚毁荷战船1艘，生擒荷将1名，溺毙荷兵数百。10月22日，由郑芝龙带领，明军战船一百50多艘（其中50艘为特大战船）在金门料罗湾追上荷兰、刘香战船，经过一番激战，刘香逃之夭夭，普特曼斯狼狈退回台湾。郑芝龙声势大振，普特曼斯只好放弃与刘香勾结，转而与郑芝龙修好。郑芝龙也不愿长期树敌，双方同意进行贸易往来。于是福建的商船开始开抵台湾。崇祯七年（1634）5月23日，郑芝龙在广东田尾洋又大败刘香，刘香引火自尽。

刘香死后，台湾海峡恢复安宁，原来害怕海贼伏击的大陆商船开始源源驶向台湾。例如崇祯九年（1636）11月、12月，自大陆到台湾的船只有33艘，次年8月达29艘，崇祯十一年（1638年）6月更达31艘之多。从这个时候开始，东南海疆唯郑芝龙之命是从，海上的船只没有郑氏的令旗，不能往来台湾海峡；荷兰人的舰队慑于郑芝龙的声势，也不敢妄动，郑芝龙成为傲视东西洋的“闽海王”。

在西方殖民者东来之后，郑芝龙顺势而起，整合中国海商势力，控制中国对外贸易，可谓明末中国海商的头号人物。