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赤潮的发生是各种自然因素综合作用的结果，如光照、风力等天气因素，海水温度、盐度、流速、流向等水文因素，营养盐、微量元素及赤潮生物自身等生物化学因素都必须考虑进来。
同时，我们人类活动所造成的水体富营养化是造成近年来赤潮频发的主要原因之一。人类过度的污水排放及水产养殖过程中剩余在水体中的饲料都是海水营养盐浓度飙升的根源。
图3 影响赤潮发生的各种自然因素
我国是一个赤潮灾害频发的国家。近几年来，赤潮发生的频率不断提高，规模不断扩大。1933～1989年，我国海域（不包括台湾省）有记录的赤潮达40余次。90年代以后，发生频率显著提高，仅2001～2007年年均发生次数就达到90次；造成的灾害也日趋严重，其中2001年就造成直接经济损失10亿元之巨。下表是本世纪中国海赤潮发生的概况。
2001-2007年中国海赤潮发生次数和面积
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年份
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2001
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2002
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2003
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2004
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2005
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2006
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2007
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赤潮次数
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77
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79
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119
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96
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82
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93
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82
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赤潮面积(平方公里)
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15000
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10000
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14550
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26630
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27070
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19840
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11610
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